LIETUVOS RESPUBLIKOS SVEIKATOS APSAUGOS MINISTRAS
ĮSAKYMAS
DĖL LIGŲ IR SVEIKATOS BŪKLIŲ, KURIOMS ESANT ATLIEKAMI PRIVALOMOJO SVEIKATOS DRAUDIMO FONDO BIUDŽETO LĖŠOMIS APMOKAMI NAVIKO GENETIKOS TYRIMAI, SĄRAŠŲ IR minimalIŲ ŠIŲ TYRIMŲ SKYRIMO IR ATLIKIMO reikalavimŲ APRAŠŲ PATVIRTINIMO
2024 m. spalio 31 d. Nr. V-1058
Vilnius
1. T v i r t i n u pridedamus:
1.1. Ligų ir sveikatos būklių, kurioms esant atliekamas Privalomojo sveikatos draudimo fondo biudžeto lėšomis apmokamas naviko molekulinės genetikos tyrimas DNR sekoskaitos metodu, sąrašą ir minimalių šio tyrimo skyrimo ir atlikimo reikalavimų aprašą;
1.2. Ligų ir sveikatos būklių, kurioms esant atliekamas Privalomojo sveikatos draudimo fondo biudžeto lėšomis apmokamas naviko molekulinio kariotipavimo tyrimas, sąrašą ir minimalių šio tyrimo skyrimo ir atlikimo reikalavimų aprašą;
PATVIRTINTA
Lietuvos Respublikos
sveikatos apsaugos ministro
2024 m. spalio 31d. įsakymu Nr. V-1058
Ligų ir SVEIKATOS būklių, kurioms esant atliekamAS Privalomojo sveikatos draudimo fondo biudžeto lėšomis APMOKAmAS NAVIKO MOLEKULINĖS GENETIKOS TYRIMAS DNR sekoskaitos METODU, SĄRAŠAS IR minimalIŲ ŠIO TYRIMO SKYRIMO IR ATLIKIMO reikalavimŲ APRAŠAS
1. Ligos ir būklės, kurioms esant atliekamas Privalomojo sveikatos draudimo fondo biudžeto lėšomis apmokamas naviko molekulinės genetikos tyrimas DNR sekoskaitos metodu, ir šio tyrimo skyrimo reikalavimai:
Pacientui įtariama arba nustatyta diagnozė |
Pacientui įtariamos arba nustatytos diagnozės kodas pagal Tarptautinės statistinės ligų ir sveikatos sutrikimų klasifikacijos dešimtąjį pataisytą ir papildytą leidimą „Sisteminis ligų sąrašas“ (Australijos modifikacija, TLK-10-AM) (toliau – TLK-10-AM) |
Naviko molekulinės genetikos tyrimo DNR sekoskaitos metodu skyrimo indikacijos |
Asmens sveikatos priežiūros įstaiga ir gydytojo, turinčio teisę skirti naviko molekulinės genetikos tyrimą DNR sekoskaitos metodu, profesinė kvalifikacija |
Navikai |
C00–C80 |
1. Kai pacientui atlikto morfologinio ir imunohistocheminio tyrimo nepakanka ligos, kurios kodas pagal TLK-10-AM C00–C80, diagnozei ir (ar) genetinei aberacijai netiesioginiu būdu nustatyti. 2. Pacientui įtariamos arba patvirtintos ligos, kurios kodas pagal TLK-10-AM C00–C80, diagnostikos ir (ar) gydymo taktikai parinkti. |
Onkologijos klasteriui priklausančioje asmens sveikatos priežiūros įstaigoje* dirbantis vienas iš šių gydytojų: 1. gydytojas onkologas chemoterapeutas (suaugusiesiems); 2. gydytojas vaikų onkohematologas (vaikams); 3. kitos profesinės kvalifikacijos gydytojas specialistas (daugiadalykės gydytojų specialistų komandos narys), gydantis pacientą dėl įtariamos arba patvirtintos ligos, kurios kodas pagal TLK-10-AM C00–C80, pagal to gydytojo specialisto medicinos normoje nustatytą kompetenciją. |
* Vadovaujantis Lietuvos Respublikos sveikatos apsaugos ministro 2017 m. vasario 17 d. įsakymu Nr. V-156 „Dėl Onkologinėmis ligomis sergančių pacientų srautų valdymo ir paslaugų organizavimo reikalavimų aprašo patvirtinimo“.
2. Minimalūs genų ir jų sričių ištyrimo reikalavimai:
Genai |
Tiriama visa nurodyta geno sritis +5 bp abipus |
ALK |
20–29 egzonai |
BRAF |
11, 15 egzonai |
BRCA1 |
1–24 egzonai |
BRCA2 |
1–27 egzonai |
EGFR |
18–21 egzonai |
FGFR1 |
7–10, 12, 15 egzonai |
FGFR2 |
7–10, 12, 15 egzonai |
FGFR3 |
7–10, 12, 15 egzonai |
IDH1 |
4 egzonas |
IDH2 |
4 egzonas |
KIT |
9, 11, 13, 17 egzonai |
KRAS |
2–4 egzonai |
NRAS |
2–4 egzonai |
PDGFRA |
12, 14, 18 egzonai |
PIK3CA |
7, 9, 20 egzonai |
POLE |
9–14 egzonai |
RET |
10, 11, 13, 15, 16 egzonai |
TERT |
Promotoriaus sritis, apimant -124C ir -146C pozicijas |
TP53 |
2–11 egzonai |
3. Minimalūs naviko molekulinės genetikos tyrimo DNR sekoskaitos metodu tyrimo atlikimo reikalavimai:
Reikalavimas |
Reikšmė |
Nuskaitytų bazių Q30 kokybinis rodiklis |
≥ 80 % |
Minimalus vidutinis DNR sekos nuskaitymo gylis |
≥ 500x |
Minimalus nuskaitomo fragmento ilgis |
100 bp |
Sekoskaitos pirminių duomenų formatas |
.fastq |
Genų variantų aptikimo riba (jautrumas) |
≥ 5 % |
Bioinformacinės analizės įrankiai |
Prilyginimo, žaliavinių duomenų kokybės vertinimo, somatinių variantų atrankos, variantų anotavimo, kopijų skaičiaus pokyčių nustatymo BRCA1 ir BRCA2 genams |
Pirminių sekoskaitos duomenų formatas |
.fastq |
Antrinių sekoskaitos duomenų formatas |
.vcf |
Tyrimo specifiškumas esant ≥ 5 % aptikimo ribai |
≥ 90 % |
Ėminio tipas |
Fiksuotas ar nefiksuotas audinys ar skystis |
PATVIRTINTA
Lietuvos Respublikos
sveikatos apsaugos ministro
2024 m. spalio 31 d. įsakymu Nr. V-1058
Ligų ir SVEIKATOS būklių, kurioms esant atliekamAS Privalomojo sveikatos draudimo fondo biudžeto lėšomis APMOKAmAS NAVIKO MOLEKULINIO KARIOTIPAVIMO tyrimaS, SĄRAŠAS IR minimalIŲ ŠIO TYRIMO SKYRIMO IR ATLIKIMO reikalavimŲ APRAŠAS
1. Ligos ir būklės, kurioms esant atliekamas Privalomojo sveikatos draudimo fondo biudžeto lėšomis apmokamas naviko molekulinio kariotipavimo tyrimas, ir šio tyrimo skyrimo reikalavimai:
Eil. Nr. |
Pacientui įtariama arba nustatyta diagnozė |
Pacientui įtariamos arba nustatytos diagnozės kodas pagal Tarptautinės statistinės ligų ir sveikatos sutrikimų klasifikacijos dešimtąjį pataisytą ir papildytą leidimą „Sisteminis ligų sąrašas“ (Australijos modifikacija, TLK-10-AM) (toliau – TLK-10-AM) |
Naviko molekulinio kariotipavimo tyrimo skyrimo indikacijos
|
Asmens sveikatos priežiūros įstaiga ir gydytojo, turinčio teisę skirti naviko molekulinio kariotipavimo tyrimą, profesinė kvalifikacija |
1. |
Kaulų ir sąnarinių kremzlių piktybiniai navikai |
C40–C41 |
1. Kai pacientui atlikto morfologinio ir imunohistocheminio tyrimo nepakanka ligos, kurios kodas pagal TLK-10-AM C40–C41, C45, C47, C49, C70–72, diagnozei ir (ar) genetinei aberacijai netiesioginiu būdu nustatyti. 2. Pacientui įtariamos arba patvirtintos ligos, kurios kodas pagal TLK-10-AM C40–C41, C45, C47, C49, C70–72, diagnostikos ir (ar) gydymo taktikai parinkti. |
Onkologijos klasteriui priklausančioje asmens sveikatos priežiūros įstaigoje* dirbantis vienas iš šių gydytojų: 1. gydytojas onkologas chemoterapeutas (suaugusiesiems); 2. gydytojas vaikų onkohematologas (vaikams); 3. kitos profesinės kvalifikacijos gydytojas specialistas (daugiadalykės gydytojų specialistų komandos narys), gydantis pacientą dėl įtariamos arba patvirtintos ligos, kurios kodas pagal TLK-10-AM C40–C41, C45, C47, C49, C70–72, pagal to gydytojo specialisto medicinos normoje nustatytą kompetenciją. |
2. |
Mezotelinių ir minkštųjų audinių piktybiniai navikai |
C45 C47 C49 |
||
3. |
Akių, smegenų ir kitų centrinės nervų sistemos dalių piktybiniai navikai |
C70–C72 |
* Vadovaujantis Lietuvos Respublikos sveikatos apsaugos ministro 2017 m. vasario 17 d. įsakymu Nr. V-156 „Dėl Onkologinėmis ligomis sergančių pacientų srautų valdymo ir paslaugų organizavimo reikalavimų aprašo patvirtinimo“.
2. Minimali naviko molekulinio kariotipavimo tyrimo apimtis – visas genomas. Molekuliniu kariotipavimu tiriami vieno nukleotido polimorfizmo (toliau – VNP) žymenys, išsidėstę visame žmogaus genome ne didesniu negu 4 kb atstumu.
3. Minimalūs naviko molekulinio kariotipavimo tyrimo atlikimo reikalavimai:
Reikalavimas |
Reikšmė |
Naudojamų VNP žymenų kiekis |
≥ 300 tūkst. VNP |
VNP žymenų nuskaitymo dažnis |
≥ 9 8 % |
Skiriamoji geba |
≥ 500 Kbp |
Tyrimo specifiškumas esant ≥ 10 % aptikimo ribai |
> 90 % |
Mikrolustų ar sekoskaitos technologija aptinkami chromosomų skaičiaus pokyčiai |
Taip |
Mikrolustų ar sekoskaitos technologija aptinkami chromosomų struktūriniai pokyčiai |
Taip |
Mikrolustų ar sekoskaitos technologija aptinkami chromosomų heterozigotiškumo praradimai |
Taip |
Ėminio tipas |
Fiksuotas ar nefiksuotas audinys ar skystis |
PATVIRTINTA
Lietuvos Respublikos
sveikatos apsaugos ministro
2024 m. spalio 31 d. įsakymu Nr. V-1058
Ligų ir SVEIKATOS būklių, kurioms esant atliekamAS Privalomojo sveikatos draudimo fondo biudžeto lėšomis APMOKAMAS NAVIKO genomo metilinimo tyrimaS, SĄRAŠAS IR minimalIŲ ŠIO TYRIMO SKYRIMO IR ATLIKIMO reikalavimų aprašas
1. Ligos ir būklės, kurioms esant atliekamas Privalomojo sveikatos draudimo fondo biudžeto lėšomis apmokamas naviko genomo metilinimo tyrimas, ir šio tyrimo skyrimo reikalavimai:
Eil. Nr. |
Pacientui įtariama arba nustatyta diagnozė |
Pacientui įtariamos arba nustatytos diagnozės kodas pagal Tarptautinės statistinės ligų ir sveikatos sutrikimų klasifikacijos dešimtąjį pataisytą ir papildytą leidimą „Sisteminis ligų sąrašas“ (Australijos modifikacija, TLK-10-AM) (toliau – TLK-10-AM) |
Naviko genomo metilinimo tyrimo skyrimo indikacijos |
Asmens sveikatos priežiūros įstaiga ir gydytojo, turinčio teisę skirti naviko genomo metilinimo tyrimą, profesinė kvalifikacija |
1. |
Kaulų ir sąnarinių kremzlių piktybiniai navikai |
C40–C41 |
1. Kai pacientui atlikto morfologinio ir imunohistocheminio tyrimo nepakanka ligos, kurios kodas pagal TLK-10-AM C40–C41, C45, C47, C49, C70–72, diagnozei ir (ar) genetinei aberacijai netiesioginiu būdu nustatyti. 2. Pacientui įtariamos arba patvirtintos ligos, kurios kodas pagal TLK-10-AM C40–C41, C45, C47, C49, C70–72, diagnostikos ir (ar) gydymo taktikai parinkti. |
Onkologijos klasteriui priklausančioje asmens sveikatos priežiūros įstaigoje* dirbantis vienas iš šių gydytojų: 1. gydytojas onkologas chemoterapeutas (suaugusiesiems); 2. gydytojas vaikų onkohematologas (vaikams); 3. kitos profesinės kvalifikacijos gydytojas specialistas (daugiadalykės gydytojų specialistų komandos narys), gydantis pacientą dėl įtariamos arba patvirtintos ligos, kurios kodas pagal TLK-10-AM C40–C41, C45, C47, C49, C70–72, pagal to gydytojo specialisto medicinos normoje nustatytą kompetenciją. |
2. |
Mezotelinių ir minkštųjų audinių piktybiniai navikai |
C45 C47 C49 |
||
3. |
Akių, smegenų ir kitų centrinės nervų sistemos dalių piktybiniai navikai |
C70–C72 |
* Vadovaujantis Lietuvos Respublikos sveikatos apsaugos ministro 2017 m. vasario 17 d. įsakymu Nr. V-156 „Dėl Onkologinėmis ligomis sergančių pacientų srautų valdymo ir paslaugų organizavimo reikalavimų aprašo patvirtinimo“.
2. Minimali naviko genomo metilinimo tyrimo apimtis – ištiriami vieno nukleotido polimorfizmo žymenys, išsidėstę genų stipriklių, promotorių bei egzonų CpG dinukleotidų srityse.
3. Minimalūs naviko genomo metilinimo tyrimo atlikimo reikalavimai:
Reikalavimas |
Reikšmė |
Naudojamų VNP žymenų kiekis |
≥ 850 tūkst. VNP žymenų |
VNP žymenų nuskaitymo dažnis |
≥ 98 % |
Bylų formatas duomenų analizei |
.idat formatas |
Centrinės nervų sistemos metilinimo profilio klasifikatoriaus nuoroda |
https://www.molecularneuropathology.org/mnp/ |
O6-metilguanino-DNR metiltransferazės geno promotoriaus metilinimo būklės nustatymas |
Atliekamas |
Centrinės nervų sistemos naviko specifinio metilinimo profilio nustatymas |
Atliekamas |
Jungiamojo audinio navikų specifinio metilinimo profilio nustatymas |
Atliekamas |
Ėminio tipas |
Fiksuotas ar nefiksuotas audinys ar skystis |
Metilinimo analizės algoritmas, nurodytas Pasaulio sveikatos organizacijos Centrinės nervų sistemos diagnozių klasifikatoriuje, 5-asis leidimas, 2021 m. |
https://publications.iarc.fr/Book-And-Report-Series/Who-Classification-Of-Tumours/Central-Nervous-System-Tumours-2021 |